Un VPN permet de faire transiter des informations, entre les différents membres de ce VPN, de manière sécurisée. Mais pour fonctionner le VPN a besoin d'utiliser un protocole. Il existe plusieurs types de protocoles VPN fonctionnant sur différentes couches réseau, voici les VPN que nous pouvons mettre en place sur un serveur dédié ou à la maison. Voici les principaux protocoles VPN, ceux que l'on trouve le plus souvent installé sur les systèmes et le plus souvent proposés par les fournisseurs de service VPN.

PPTP: Facile à mettre en place, mais beaucoup d'inconvénients liés à la lourdeur du protocole de transport GRE, le matériel réseau (routeur ADSL, wifi, doit être compatible avec le PPTP). C'est un protocole VPN très fréquent.
L2TP: signifie protocole de tunnelisation VPN de niveau 2. Il s'agit d'un protocole réseau utilisé pour créer des réseaux privés virtuels, le plus souvent entre un opérateur de collecte de trafic (fournisseur ADSL ou opérateur de téléphonie pour les accès RTC) et les fournisseurs d'accès à Internet.
IPsec: Plus efficace que le PPTP en termes de performances, mais aussi très contraignant au niveau de la mise en place.
SSTP: est un type de tunnel VPN qui fournit un mécanisme pour transporter PPP ou L2TP à travers un canal SSL 3.0. SSL fournit une sécurité au niveau transport avec une négociation de clés, le cryptage, et le contrôle de l'intégrité des données. L'utilisation de SSL sur le port TCP 443 (HTTPS) permet à ce protocole SSTP de passer facilement à travers les firewalls et les serveurs Proxy.
OpenVPN: Ce n'est pas un vrai protocole mais c'est un des plus intéressant car on peut installer ce logiciel sur toutes les plateformes.